Certifikace systému enviromentálního managementu (EMS) podle ISO 14001 vytváří v organizaci předpoklady pro:
Základní podmínkou pro zahájení certifikace je zdokumentovaný a vybudovaný systém enviromentálního managementu podle ČSN EN ISO 14001:2005.
Povinností zákazníka je zpřístupnit auditnímu týmu prostory a dokumenty, které se týkají certifikace, rovněž tak umožnit pohovory s dotčenými pracovníky. Po ukončení auditu poskytuje zákazník svoje stanovisko k jednotlivým zjištěním, tj. k systémovým či nesystémovým neshodám a k doporučením ke zlepšení – toto platí pro audit 1. i 2. stupně.
Pokud nebyly zjištěny více než tři systémové neshody lze přistoupit k auditu EMS 2. stupně (tento audit však může být zahájen až po odstranění neshod z auditu EMS 1. stupně), pokud systémových neshod bylo více, musí se audit EMS 1. stupně opakovat.
Konkrétně se auditoři zaměřují na: